Documentation iTafaray

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  • Introduction
    • Présentation
    • Objectif de cette documentation
    • Guides mis en avant

Deploiement et securite

  • Guide d’installation de HAPI FHIR sur AWS EC2
    • Objectif du document
    • 1. Architecture cible
    • 2. Prérequis AWS
      • 2.1 Instance EC2 recommandée
      • 2.2 Règles du Security Group
      • 2.3 Connexion SSH à l’instance
    • 3. Mise à jour et prérequis système Amazon Linux 2023
    • 4. Installation de Docker sur Amazon Linux 2023
    • 5. Installation de Docker Compose sur Amazon Linux 2023
    • 6. Préparation des fichiers HAPI FHIR
      • 6.1 Création du fichier .env
      • 6.2 Création du fichier docker-compose.yml
      • 6.3 Démarrage des conteneurs
    • 7. Vérifications locales de HAPI FHIR
    • 8. Installation et configuration de Nginx sur Amazon Linux 2023
      • 8.1 Configuration reverse proxy HTTP
    • 9. Exemples de requêtes FHIR
    • 10. Sources consultées
  • Guide d’installation du serveur de sécurité X-Road
    • 1. Objectif
    • 2. Installation
      • 2.1 Vérification des prérequis
      • 2.2 Installation de Java 21
      • 2.3 Préparation du système d’exploitation
      • 2.4 Configuration du dépôt de paquets
      • 2.5 Configuration de la base de données
      • 2.6 Installation du serveur de sécurité
      • 2.7 Démarrage du serveur de sécurité
      • 2.8 Vérification post-installation
    • 3. Configuration initiale
      • 3.1 Saisie du code PIN
      • 3.2 Configuration du service d’horodatage
      • 3.3 Création des certificats
      • 3.4 Importation des certificats
      • 3.5 Enregistrement du certificat d’authentification
  • Architecture de protection serveur portable
    • Documents disponibles
    • Vue d’ensemble
    • Pile recommandee
    • Ordre recommande de mise en place
    • Points de vigilance

Documentation du projet

  • Documentation FHIR — ONE HEALTH
    • 1. Sélection des ressources
      • Définition des ressources par secteur
    • 2. Endpoints des API REST
      • 2.1 — Patient
      • 2.2 — Practitioner
      • 2.3 — Organization
      • 2.4 — Location
      • 2.5 — Group
      • 2.6 — RelatedPerson
      • 2.7 — Substance
      • 2.8 — Encounter
      • 2.9 — Observation
      • 2.10 — Condition
      • 2.11 — MedicationRequest
      • 2.12 — Medication
      • 2.13 — Immunization
      • 2.14 — RiskAssessment
      • 2.15 — Composition
      • 2.16 — DocumentReference
      • 2.17 — MessageHeader
      • 2.18 — Provenance
      • 2.19 — Interactions au niveau système
    • 3. Requêtes courantes
      • 3.1 — Location
      • 3.2 — Signaux épidémiologiques
      • 3.3 — Évaluations SBEC
      • 3.4 — Communications / Alertes
      • 3.5 — Requêtes existantes (4 piliers cliniques)
    • 4. Formats des données
      • 4.1 — Formats d’échange supportés
      • 4.2 — Structure générale d’une ressource FHIR
      • 4.3 — Systèmes de codification (CodeSystems)
      • 4.4 — Terminologies et ValueSets
      • 4.5 — Extensions personnalisées PIVOT
      • 4.6 — Format des identifiants
      • 4.7 — Format des Bundles
      • 4.8 — Format des réponses HTTP
    • 5. Exemple complet — Visite ASC avec diagnostic paludisme
    • 6. Création des Profils
  • Documentation FHIR R4 — Système de Surveillance SBE
    • 1. Sélection des ressources
      • 1.1 Contexte et objectifs
      • 1.2 Ressources FHIR sélectionnées
      • 1.3 Relations entre ressources
      • 1.4 Flux de données SBEC
    • 2. Endpoints des API REST
      • 2.1 Location — Hiérarchie géographique
      • 2.2 Observation — Signaux épidémiologiques
      • 2.3 Group — Regroupement
      • 2.4 RiskAssessment — SBEC_Evaluation
      • 2.5 Substance
      • 2.6 Communication — Alertes
      • 2.7 Ressources cliniques — Patient, Encounter, Condition, MedicationRequest
      • 2.8 Paramètres de recherche
    • 3. Format
      • 3.1 Formats de données FHIR
      • 3.2 Format Bundle — lot de ressources
      • 3.3 Format searchset — réponse de recherche
      • 3.4 Format OperationOutcome — erreurs et avertissements
      • 3.5 Format de pagination
    • 4. Profils
      • 4.1 Profil PivotLocation
      • 4.2 Profil PivotObservationSignal
      • 4.3 Profil PivotGroup
      • 4.4 Profil PivotRiskAssessment — SBEC_Evaluation
      • 4.5 Profil PivotSubstance
      • 4.6 Profil PivotCommunication
      • 4.7 Profils cliniques existants — 4 Piliers
      • 4.8 Extensions PIVOT
      • 4.9 Terminologies et ValueSets
      • 4.10 Exemples JSON — Scénario complet SBEC
  • Services X-Road exposés pour la SBE
    • Ressources FHIR de base
    • Catalogue des services exposes
    • Règles de lecture X-Road et FHIR
  • Infrastructure iTafaray
    • 1. Objet et périmètre de l’infrastructure
    • 2. Vue d’ensemble de la configuration mise à jour
    • 3. Description des couches fonctionnelles
      • 3.1 Couche d’entrée et stockage
      • 3.2 Couche d’interopérabilité
      • 3.3 Couche d’échange
      • 3.4 Couche de visualisation
    • 4. Description des composants techniques
    • 5. Légendes et flux de données
    • 6. Chaîne fonctionnelle de bout en bout
    • 7. Sécurité, contrôle et conformité
    • 8. Données, stockage et sauvegarde
    • 9. Exploitation, supervision et maintenance
    • 10. Points d’attention et recommandations
      • 10.1 Formaliser les contrats d’échange
      • 10.2 Définir les mappings vers FHIR
      • 10.3 Clarifier les échanges bidirectionnels
      • 10.4 Prévoir un environnement de test
      • 10.5 Mettre en place une gouvernance de sécurité
    • 11. Annexes
      • 11.1 Diagramme textuel simplifié
      • 11.2 Schéma de référence mis à jour
  • Documentation technique
    • Ressources disponibles
    • Architecture ONE HEALTH
    • Présentation FHIR
    • Signaux prioritaires SBE
    • Liens de documentation web
  • Supports et outils de formation
    • Évolution des risques sanitaires
    • One Health
    • Enjeux transversaux en One Health
    • Climat et santé
    • Maladies émergentes et évaluation du risque
    • Introduction à la collaboration et à l'intervention conjointe
    • Comprendre l'apprentissage des adultes
    • Animer une réunion
    • Sensibilisation communautaire
    • Structuration d'un message communautaire
    • Affiches et fiches EBOSURSY
      • Cycle du virus de la variole simienne
      • Moustiques et tiques : comment se protéger ?
      • Viande de brousse : précautions
      • Surveillance intégrée à base communautaire des zoonoses
      • Rôle communautaire dans la surveillance des zoonoses
      • Haromotana : prévention de la rage
    • Grands principes de surveillance
    • Modalités de surveillance
    • Surveillance intégrée à Madagascar
    • SBE et rôle de la communauté
    • Quelques zoonoses à Madagascar
    • Gestion des données de surveillance
    • Fiches mémo One Health
    • Tutoriels vidéo
      • Démonstration 1 : Tutoriel Commcare SBE AC
      • Démonstration 2 : Tutoriel Commcare SBE CSB
      • Démonstration 3 : Tutoriel Commcare SBE District
    • Curriculum SBE CommCare
      • FAMPIDIRANA
      • NY IANTEFAN’NY FIOFANANA
      • ZAVAKINENDRIN’NY FIOFANANA
      • FOTO-KEVITRA IAINGAN’NY FAMPIOFANANA
      • TEKNIKA HO ENTI-MAMPIOFANA
      • TANJONA ANKAPOBEN’NY FIOFANANA
      • TANJONA MANODIDINA NY FAMPIHARANA
      • VOTOATIN’NY FIOFANANA
      • TOMBANEZAKA NY FIOFANANA
      • FAHARETAN’NY FIOFANANA
      • TOROLALAM-PANOFANANA
      • LOHAHEVITRA A: FANEHOANA ANKAPOBENY NY COMMCARE
      • TOROLALAM-PANOFANANA
      • LOHAHEVITRA B: Fanaovana SBE ao amin’ny CommCare
      • Tombanezaka isanandro
    • Manuel de Formation SBE
      • TOROLALANA HO AN’NY MPAMPIOFANA
      • Fampidirana mikasika ny hetsika ara-teknolojika
      • Fanehoana ankapobeny ny fampiasana ny CommCare
      • Fitsirihina
      • Sivana sy fanamarinana
      • Evaluation/tombana
  • Mise à jour de la carte Vatovavy
    • Région Vatovavy
      • Objet
      • Périmètre
      • Environnement technique
    • Vue d’ensemble du processus
    • 1. Introduction et contexte
    • 2. Phase 1 — Préparation des données dans QGIS
      • 2.1 Extraction des données
      • 2.2 Import dans QGIS
      • 2.3 Sélection des communes Vatovavy
      • 2.4 Export sélection
      • 2.5 Vérification
      • 2.6 Nettoyage des entités
      • 2.7 Contrôle final
      • 2.8 Dissolve district
      • 2.9 Dissolve région
      • 2.10 Export final
    • 3. Phase 2 — Conversion Shapefile → GML
    • 4. Phase 3 — Structuration GML
      • Identifiants DHIS2
    • 5. Phase 4 — Import DHIS2
      • 5.1 Procédure
      • 5.3 Vérification Maps
    • 6. Checklist
    • 7. Problèmes courants

Cadres d'architecture et annexes

  • Cadre TOGAF ADM
    • Phase Preliminary
      • Objet
      • Cadre institutionnel
      • Principes d’architecture
      • Capacité d’architecture
      • Portée initiale
    • Gestion des exigences
      • Objet
      • Exigences structurantes
      • Exigences de gouvernance et de données
      • Gestion dans le cycle ADM
    • Phase A - Vision
      • Vision d’architecture
      • Objectifs prioritaires
      • Parties prenantes principales
      • Périmètre de la vision initiale
      • Résultat attendu de la phase
    • Phase B - Architecture métier
      • Finalité métier
      • Acteurs et rôles
      • Capacités métier
      • Niveaux d’alerte
      • Flux métier de référence
      • Portée fonctionnelle initiale
    • Phase C - Systèmes d’information
      • Objet
      • Architecture des données
      • Architecture applicative cible
      • Ressources FHIR documentées
      • Résultat attendu
    • Phase D - Architecture technologique
      • Objet
      • Composants autorisés
      • Principes technologiques
      • Chaîne technologique cible
      • Extensions futures
    • Phase E - Opportunités et solutions
      • Orientation générale
      • Lots de solution
      • Résultats attendus
    • Phase F - Planification de migration
      • Principe
      • Bénéfices attendus
      • Critères de passage
    • Phase G - Gouvernance de mise en oeuvre
      • Objet
      • Règles de gouvernance
      • Contrôles de conformité
      • Point d’attention MVP
    • Phase H - Gestion du changement d’architecture
      • Objet
      • Évolutions déjà prévues
      • Règles de gestion du changement
      • Maintien de la cohérence
  • Architecture de référence
    • Architecture d’entreprise
      • Vue d’ensemble
      • Périmètre
      • Couches de l’architecture
      • Principes d’ensemble
    • Architecture de gouvernance
      • Cadre de gouvernance
      • Engagements des parties prenantes
      • Domaines de décision
      • Principes de gouvernance
      • Conséquence architecturale
    • Flux métier
      • Cas d’usage initial
      • Enchaînement métier
      • Schéma de référence
      • Point d’appui du MVP
    • Architecture des données
      • Référentiel FHIR national
      • Principes de gestion des données
      • Domaines de données
      • Responsabilité de mise à disposition
      • Ressources FHIR documentées
      • Conséquence d’architecture
    • Architecture applicative
      • Vue applicative cible
      • Périmètre V1
      • Relation entre applications
      • Évolutivité
    • Architecture technologique
      • Socle technologique
      • Services techniques structurants
      • Principes d’exploitation
    • Architecture d’interopérabilité
      • Principe directeur
      • Règles d’interopérabilité
      • Chaîne d’échange
      • Responsabilités de mise en oeuvre
      • Interopérabilité cible
    • Architecture de sécurité
      • Principes de sécurité
      • Composants de sécurité
      • Mesures structurantes
    • Architecture du tableau de bord
      • Finalité
      • Rôle du tableau de bord
      • Contenu de restitution
      • Position dans l’architecture
    • Flux d’architecture
      • Flux applicatifs
      • Flux métier
  • Annexes
    • Glossaire
    • Ressources FHIR documentées
      • Inventaire
      • Rôle dans le référentiel national
    • Schémas textuels
      • Schéma de gouvernance
      • Schéma de gouvernance détaillé
      • Schéma métier MVP
      • Schéma d’interopérabilité
      • Schéma d’extension cible
    • Références
      • Références internes du projet
      • Références structurantes
Documentation iTafaray
  • Index

Index

A | C | D | E | F | G | H | I | J | L | M | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X

A

  • AC
  • ACT
  • ADM
  • ALBZ
  • AMB
  • AMOX
  • API
  • API Gateway
  • ARM
  • ASC
  • AWS EC2

C

  • CHD
  • CommCare
  • COTRI
  • CSB

D

  • DHIS2
  • DNS

E

  • EBS
  • EMER
  • EPSG

F

  • FERFS
  • FHIR
  • FLD

G

  • GDAL
  • GIS
  • GML
  • GPS

H

  • HAPI FHIR
  • HH
  • HL7 FHIR
  • HTTP
  • HTTPS

I

  • ICD
  • ID
  • IMP
  • IP
  • IRA

J

  • JPA
  • JSON

L

  • LOINC

M

  • METRO
  • MIME
  • MUAC
  • MVP

O

  • One Health
  • OpenFn
  • ORL

P

  • PARA
  • Primature
  • Pseudonymisation

Q

  • QGIS

R

  • RDF
  • REF
  • REST
  • Ré-identification contrôlée
  • Référentiel FHIR national
  • RUTF

S

  • SBE
  • SBE AC
  • SBE CSB
  • SBEC
  • SDSP
  • SIS
  • SMS
  • SRO
  • SSH
  • SSL

T

  • TDR
  • TLS

U

  • UCUM
  • UGD
  • UID
  • URL

V

  • VITA

W

  • WCS

X

  • X-Road
  • XHTML
  • XML

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